Protein–RNA interactions for Protein: O35324

Sh2d1b, SH2 domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d1bO35324 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sh2d1bO35324 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Sh2d1bO35324 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sh2d1bO35324 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sh2d1bO35324 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sh2d1bO35324 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sh2d1bO35324 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sh2d1bO35324 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sh2d1bO35324 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sh2d1bO35324 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sh2d1bO35324 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sh2d1bO35324 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sh2d1bO35324 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sh2d1bO35324 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms