Protein–RNA interactions for Protein: O35304

Slc18a3, Vesicular acetylcholine transporter, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a3O35304 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms