Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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