Protein–RNA interactions for Protein: O08543

Efna5, Ephrin-A5, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna5O08543 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Efna5O08543 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Efna5O08543 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Efna5O08543 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Efna5O08543 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Efna5O08543 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Efna5O08543 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Efna5O08543 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Efna5O08543 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Efna5O08543 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Efna5O08543 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Efna5O08543 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Efna5O08543 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Efna5O08543 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Efna5O08543 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Efna5O08543 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Efna5O08543 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Efna5O08543 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Efna5O08543 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Efna5O08543 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Efna5O08543 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Efna5O08543 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Efna5O08543 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Efna5O08543 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Efna5O08543 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Efna5O08543 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Efna5O08543 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Efna5O08543 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Efna5O08543 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Efna5O08543 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Efna5O08543 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Efna5O08543 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Efna5O08543 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Efna5O08543 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Efna5O08543 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Efna5O08543 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Efna5O08543 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Efna5O08543 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Efna5O08543 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Efna5O08543 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Efna5O08543 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Efna5O08543 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Efna5O08543 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Efna5O08543 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Efna5O08543 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Efna5O08543 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Efna5O08543 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Efna5O08543 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Efna5O08543 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Efna5O08543 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Efna5O08543 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Efna5O08543 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Efna5O08543 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Efna5O08543 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Efna5O08543 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Efna5O08543 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Efna5O08543 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Efna5O08543 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Efna5O08543 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Efna5O08543 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Efna5O08543 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Efna5O08543 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Efna5O08543 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Efna5O08543 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Efna5O08543 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Efna5O08543 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Efna5O08543 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Efna5O08543 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Efna5O08543 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Efna5O08543 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Efna5O08543 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Efna5O08543 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Efna5O08543 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Efna5O08543 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Efna5O08543 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Efna5O08543 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Efna5O08543 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Efna5O08543 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Efna5O08543 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Efna5O08543 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Efna5O08543 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Efna5O08543 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Efna5O08543 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Efna5O08543 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Efna5O08543 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Efna5O08543 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Efna5O08543 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Efna5O08543 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Efna5O08543 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Efna5O08543 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Efna5O08543 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Efna5O08543 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Efna5O08543 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Efna5O08543 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Efna5O08543 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Efna5O08543 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Efna5O08543 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Efna5O08543 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Efna5O08543 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Efna5O08543 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.3 ms