Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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