Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS0

Gm21411, Predicted gene, 21411, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21411J3KMS0 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21411J3KMS0 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21411J3KMS0 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21411J3KMS0 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21411J3KMS0 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21411J3KMS0 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21411J3KMS0 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21411J3KMS0 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21411J3KMS0 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21411J3KMS0 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21411J3KMS0 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21411J3KMS0 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21411J3KMS0 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21411J3KMS0 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21411J3KMS0 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21411J3KMS0 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21411J3KMS0 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21411J3KMS0 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21411J3KMS0 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21411J3KMS0 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21411J3KMS0 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21411J3KMS0 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21411J3KMS0 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21411J3KMS0 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21411J3KMS0 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21411J3KMS0 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21411J3KMS0 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21411J3KMS0 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21411J3KMS0 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21411J3KMS0 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21411J3KMS0 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21411J3KMS0 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21411J3KMS0 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21411J3KMS0 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21411J3KMS0 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21411J3KMS0 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21411J3KMS0 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21411J3KMS0 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21411J3KMS0 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21411J3KMS0 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21411J3KMS0 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21411J3KMS0 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21411J3KMS0 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21411J3KMS0 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21411J3KMS0 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21411J3KMS0 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21411J3KMS0 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21411J3KMS0 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21411J3KMS0 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21411J3KMS0 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21411J3KMS0 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21411J3KMS0 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21411J3KMS0 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21411J3KMS0 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21411J3KMS0 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21411J3KMS0 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21411J3KMS0 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21411J3KMS0 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21411J3KMS0 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21411J3KMS0 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21411J3KMS0 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21411J3KMS0 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21411J3KMS0 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21411J3KMS0 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21411J3KMS0 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21411J3KMS0 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21411J3KMS0 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21411J3KMS0 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21411J3KMS0 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21411J3KMS0 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21411J3KMS0 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21411J3KMS0 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21411J3KMS0 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21411J3KMS0 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21411J3KMS0 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21411J3KMS0 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21411J3KMS0 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21411J3KMS0 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21411J3KMS0 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21411J3KMS0 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21411J3KMS0 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21411J3KMS0 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21411J3KMS0 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21411J3KMS0 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21411J3KMS0 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21411J3KMS0 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21411J3KMS0 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21411J3KMS0 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21411J3KMS0 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21411J3KMS0 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21411J3KMS0 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21411J3KMS0 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21411J3KMS0 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21411J3KMS0 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21411J3KMS0 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21411J3KMS0 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21411J3KMS0 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21411J3KMS0 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21411J3KMS0 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21411J3KMS0 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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