Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Y1

Trim55, MCG19772, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim55G3X8Y1 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim55G3X8Y1 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trim55G3X8Y1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Trim55G3X8Y1 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trim55G3X8Y1 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim55G3X8Y1 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim55G3X8Y1 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim55G3X8Y1 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim55G3X8Y1 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim55G3X8Y1 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim55G3X8Y1 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim55G3X8Y1 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim55G3X8Y1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim55G3X8Y1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim55G3X8Y1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim55G3X8Y1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim55G3X8Y1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim55G3X8Y1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim55G3X8Y1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim55G3X8Y1 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim55G3X8Y1 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim55G3X8Y1 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim55G3X8Y1 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim55G3X8Y1 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim55G3X8Y1 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim55G3X8Y1 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim55G3X8Y1 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim55G3X8Y1 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim55G3X8Y1 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim55G3X8Y1 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim55G3X8Y1 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim55G3X8Y1 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim55G3X8Y1 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim55G3X8Y1 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim55G3X8Y1 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim55G3X8Y1 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim55G3X8Y1 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim55G3X8Y1 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim55G3X8Y1 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim55G3X8Y1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim55G3X8Y1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim55G3X8Y1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim55G3X8Y1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim55G3X8Y1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim55G3X8Y1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim55G3X8Y1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim55G3X8Y1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim55G3X8Y1 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim55G3X8Y1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim55G3X8Y1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim55G3X8Y1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim55G3X8Y1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim55G3X8Y1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim55G3X8Y1 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim55G3X8Y1 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim55G3X8Y1 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim55G3X8Y1 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim55G3X8Y1 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim55G3X8Y1 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim55G3X8Y1 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim55G3X8Y1 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim55G3X8Y1 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim55G3X8Y1 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim55G3X8Y1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim55G3X8Y1 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim55G3X8Y1 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim55G3X8Y1 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim55G3X8Y1 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim55G3X8Y1 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim55G3X8Y1 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim55G3X8Y1 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim55G3X8Y1 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim55G3X8Y1 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim55G3X8Y1 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim55G3X8Y1 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim55G3X8Y1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim55G3X8Y1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim55G3X8Y1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim55G3X8Y1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim55G3X8Y1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim55G3X8Y1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim55G3X8Y1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim55G3X8Y1 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim55G3X8Y1 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim55G3X8Y1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim55G3X8Y1 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim55G3X8Y1 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim55G3X8Y1 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim55G3X8Y1 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim55G3X8Y1 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim55G3X8Y1 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim55G3X8Y1 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim55G3X8Y1 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim55G3X8Y1 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim55G3X8Y1 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim55G3X8Y1 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim55G3X8Y1 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim55G3X8Y1 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim55G3X8Y1 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim55G3X8Y1 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms