Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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