Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Ctnnd1-206ENSMUST00000111675 5089 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Mmp9-201ENSMUST00000017881 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Phf21a-202ENSMUST00000068702 6023 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Apobec3-204ENSMUST00000175714 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Nhsl1-202ENSMUST00000100054 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Cfb-201ENSMUST00000025229 2737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Anks1b-203ENSMUST00000099368 2799 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Lct-201ENSMUST00000073490 6174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Zfp831-201ENSMUST00000059452 9807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Lama1-201ENSMUST00000035471 9518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Olfr804-202ENSMUST00000213331 5737 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 AC154186.1-201ENSMUST00000227711 1597 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Fbxo7-204ENSMUST00000130320 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Ovgp1-201ENSMUST00000000573 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Gm45354-201ENSMUST00000199820 2557 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Hist1h1d-201ENSMUST00000045301 7425 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Tanc1-208ENSMUST00000139863 7246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 167.4 ms