Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms