Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Phf11bB4XVQ1 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms