Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Zscan5bB2RTN3 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zscan5bB2RTN3 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zscan5bB2RTN3 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zscan5bB2RTN3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zscan5bB2RTN3 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zscan5bB2RTN3 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zscan5bB2RTN3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zscan5bB2RTN3 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zscan5bB2RTN3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zscan5bB2RTN3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zscan5bB2RTN3 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zscan5bB2RTN3 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zscan5bB2RTN3 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zscan5bB2RTN3 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zscan5bB2RTN3 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zscan5bB2RTN3 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Zscan5bB2RTN3 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zscan5bB2RTN3 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zscan5bB2RTN3 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zscan5bB2RTN3 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zscan5bB2RTN3 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Zscan5bB2RTN3 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Zscan5bB2RTN3 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zscan5bB2RTN3 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Zscan5bB2RTN3 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zscan5bB2RTN3 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zscan5bB2RTN3 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zscan5bB2RTN3 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zscan5bB2RTN3 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zscan5bB2RTN3 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zscan5bB2RTN3 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zscan5bB2RTN3 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zscan5bB2RTN3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zscan5bB2RTN3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zscan5bB2RTN3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zscan5bB2RTN3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zscan5bB2RTN3 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zscan5bB2RTN3 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zscan5bB2RTN3 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zscan5bB2RTN3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zscan5bB2RTN3 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zscan5bB2RTN3 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zscan5bB2RTN3 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zscan5bB2RTN3 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Zscan5bB2RTN3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zscan5bB2RTN3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zscan5bB2RTN3 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zscan5bB2RTN3 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zscan5bB2RTN3 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zscan5bB2RTN3 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zscan5bB2RTN3 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zscan5bB2RTN3 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zscan5bB2RTN3 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zscan5bB2RTN3 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zscan5bB2RTN3 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zscan5bB2RTN3 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zscan5bB2RTN3 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zscan5bB2RTN3 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zscan5bB2RTN3 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Zscan5bB2RTN3 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zscan5bB2RTN3 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zscan5bB2RTN3 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zscan5bB2RTN3 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zscan5bB2RTN3 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zscan5bB2RTN3 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zscan5bB2RTN3 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zscan5bB2RTN3 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zscan5bB2RTN3 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zscan5bB2RTN3 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zscan5bB2RTN3 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zscan5bB2RTN3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zscan5bB2RTN3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zscan5bB2RTN3 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zscan5bB2RTN3 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zscan5bB2RTN3 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zscan5bB2RTN3 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zscan5bB2RTN3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zscan5bB2RTN3 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zscan5bB2RTN3 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zscan5bB2RTN3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zscan5bB2RTN3 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms