Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
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