Protein–RNA interactions for Protein: A2ALK8

Ptpn3, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 3, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn3A2ALK8 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn3A2ALK8 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn3A2ALK8 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn3A2ALK8 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn3A2ALK8 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn3A2ALK8 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn3A2ALK8 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn3A2ALK8 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn3A2ALK8 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn3A2ALK8 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn3A2ALK8 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn3A2ALK8 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn3A2ALK8 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn3A2ALK8 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn3A2ALK8 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn3A2ALK8 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn3A2ALK8 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn3A2ALK8 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn3A2ALK8 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn3A2ALK8 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn3A2ALK8 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn3A2ALK8 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn3A2ALK8 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn3A2ALK8 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn3A2ALK8 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn3A2ALK8 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn3A2ALK8 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn3A2ALK8 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn3A2ALK8 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn3A2ALK8 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn3A2ALK8 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn3A2ALK8 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn3A2ALK8 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn3A2ALK8 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn3A2ALK8 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn3A2ALK8 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn3A2ALK8 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn3A2ALK8 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn3A2ALK8 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn3A2ALK8 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn3A2ALK8 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn3A2ALK8 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn3A2ALK8 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn3A2ALK8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn3A2ALK8 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn3A2ALK8 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn3A2ALK8 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn3A2ALK8 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn3A2ALK8 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn3A2ALK8 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn3A2ALK8 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn3A2ALK8 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn3A2ALK8 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn3A2ALK8 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn3A2ALK8 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn3A2ALK8 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn3A2ALK8 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn3A2ALK8 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn3A2ALK8 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn3A2ALK8 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn3A2ALK8 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn3A2ALK8 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn3A2ALK8 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn3A2ALK8 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn3A2ALK8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn3A2ALK8 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn3A2ALK8 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn3A2ALK8 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn3A2ALK8 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn3A2ALK8 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn3A2ALK8 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn3A2ALK8 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn3A2ALK8 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn3A2ALK8 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn3A2ALK8 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn3A2ALK8 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn3A2ALK8 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn3A2ALK8 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn3A2ALK8 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn3A2ALK8 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn3A2ALK8 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn3A2ALK8 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn3A2ALK8 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn3A2ALK8 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn3A2ALK8 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn3A2ALK8 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn3A2ALK8 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn3A2ALK8 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn3A2ALK8 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn3A2ALK8 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn3A2ALK8 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn3A2ALK8 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn3A2ALK8 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ptpn3A2ALK8 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ptpn3A2ALK8 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ptpn3A2ALK8 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ptpn3A2ALK8 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ptpn3A2ALK8 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ptpn3A2ALK8 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ptpn3A2ALK8 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms