Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
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Lcn6A2AJB9 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
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Lcn6A2AJB9 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Lcn6A2AJB9 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms