Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms