Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm3550W4VSN7 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm3550W4VSN7 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm3550W4VSN7 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm3550W4VSN7 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm3550W4VSN7 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm3550W4VSN7 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm3550W4VSN7 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm3550W4VSN7 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm3550W4VSN7 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm3550W4VSN7 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm3550W4VSN7 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm3550W4VSN7 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm3550W4VSN7 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm3550W4VSN7 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm3550W4VSN7 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm3550W4VSN7 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm3550W4VSN7 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm3550W4VSN7 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm3550W4VSN7 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm3550W4VSN7 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm3550W4VSN7 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm3550W4VSN7 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm3550W4VSN7 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm3550W4VSN7 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm3550W4VSN7 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm3550W4VSN7 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm3550W4VSN7 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm3550W4VSN7 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm3550W4VSN7 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm3550W4VSN7 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm3550W4VSN7 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm3550W4VSN7 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm3550W4VSN7 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm3550W4VSN7 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm3550W4VSN7 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm3550W4VSN7 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm3550W4VSN7 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm3550W4VSN7 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm3550W4VSN7 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm3550W4VSN7 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm3550W4VSN7 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm3550W4VSN7 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm3550W4VSN7 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm3550W4VSN7 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm3550W4VSN7 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm3550W4VSN7 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm3550W4VSN7 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm3550W4VSN7 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm3550W4VSN7 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm3550W4VSN7 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm3550W4VSN7 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm3550W4VSN7 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm3550W4VSN7 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm3550W4VSN7 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm3550W4VSN7 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm3550W4VSN7 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm3550W4VSN7 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm3550W4VSN7 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm3550W4VSN7 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm3550W4VSN7 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm3550W4VSN7 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm3550W4VSN7 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm3550W4VSN7 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm3550W4VSN7 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm3550W4VSN7 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm3550W4VSN7 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm3550W4VSN7 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm3550W4VSN7 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm3550W4VSN7 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm3550W4VSN7 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm3550W4VSN7 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm3550W4VSN7 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm3550W4VSN7 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm3550W4VSN7 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm3550W4VSN7 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm3550W4VSN7 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm3550W4VSN7 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm3550W4VSN7 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm3550W4VSN7 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm3550W4VSN7 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm3550W4VSN7 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm3550W4VSN7 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm3550W4VSN7 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm3550W4VSN7 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm3550W4VSN7 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm3550W4VSN7 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm3550W4VSN7 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm3550W4VSN7 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm3550W4VSN7 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm3550W4VSN7 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm3550W4VSN7 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm3550W4VSN7 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm3550W4VSN7 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm3550W4VSN7 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm3550W4VSN7 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm3550W4VSN7 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm3550W4VSN7 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm3550W4VSN7 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm3550W4VSN7 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms