Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms