Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Pdpk1Q9Z2A0 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pdpk1Q9Z2A0 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pdpk1Q9Z2A0 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pdpk1Q9Z2A0 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pdpk1Q9Z2A0 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pdpk1Q9Z2A0 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pdpk1Q9Z2A0 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pdpk1Q9Z2A0 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Pdpk1Q9Z2A0 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Pdpk1Q9Z2A0 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Pdpk1Q9Z2A0 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Pdpk1Q9Z2A0 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Pdpk1Q9Z2A0 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Pdpk1Q9Z2A0 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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