Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z184

Padi3, Protein-arginine deiminase type-3, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Padi3Q9Z184 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms