Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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TapbpQ9R233 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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TapbpQ9R233 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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TapbpQ9R233 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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TapbpQ9R233 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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TapbpQ9R233 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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TapbpQ9R233 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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TapbpQ9R233 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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TapbpQ9R233 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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TapbpQ9R233 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
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