Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms