Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA5

Lsm4, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm4Q9QXA5 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms