Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Rabgef1Q9JM13 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Rabgef1Q9JM13 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Rabgef1Q9JM13 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Rabgef1Q9JM13 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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