Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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