Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms