Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK7

Tmod2, Tropomodulin-2, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod2Q9JKK7 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmod2Q9JKK7 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmod2Q9JKK7 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmod2Q9JKK7 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmod2Q9JKK7 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmod2Q9JKK7 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmod2Q9JKK7 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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Tmod2Q9JKK7 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
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Tmod2Q9JKK7 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmod2Q9JKK7 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmod2Q9JKK7 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmod2Q9JKK7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmod2Q9JKK7 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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Tmod2Q9JKK7 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmod2Q9JKK7 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
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Tmod2Q9JKK7 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmod2Q9JKK7 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmod2Q9JKK7 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmod2Q9JKK7 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmod2Q9JKK7 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmod2Q9JKK7 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmod2Q9JKK7 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmod2Q9JKK7 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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Tmod2Q9JKK7 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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Tmod2Q9JKK7 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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Tmod2Q9JKK7 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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Tmod2Q9JKK7 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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Tmod2Q9JKK7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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Tmod2Q9JKK7 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
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Tmod2Q9JKK7 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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Tmod2Q9JKK7 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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