Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Usp29Q9ES63 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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