Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms