Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC53

Cpne8, Copine-8, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne8Q9DC53 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms