Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Swt1Q9DBQ9 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Swt1Q9DBQ9 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Swt1Q9DBQ9 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Swt1Q9DBQ9 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Swt1Q9DBQ9 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Swt1Q9DBQ9 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Swt1Q9DBQ9 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Swt1Q9DBQ9 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Swt1Q9DBQ9 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Swt1Q9DBQ9 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Swt1Q9DBQ9 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Swt1Q9DBQ9 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Swt1Q9DBQ9 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Swt1Q9DBQ9 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Swt1Q9DBQ9 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Swt1Q9DBQ9 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms