Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Smg9Q9DB90 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Smg9Q9DB90 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Smg9Q9DB90 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Smg9Q9DB90 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smg9Q9DB90 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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