Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F9

Tubb4a, Tubulin beta-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4aQ9D6F9 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms