Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F4

Gabra4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra4Q9D6F4 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gabra4Q9D6F4 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gabra4Q9D6F4 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gabra4Q9D6F4 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gabra4Q9D6F4 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gabra4Q9D6F4 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gabra4Q9D6F4 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gabra4Q9D6F4 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gabra4Q9D6F4 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gabra4Q9D6F4 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gabra4Q9D6F4 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gabra4Q9D6F4 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gabra4Q9D6F4 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gabra4Q9D6F4 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gabra4Q9D6F4 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gabra4Q9D6F4 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gabra4Q9D6F4 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gabra4Q9D6F4 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gabra4Q9D6F4 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gabra4Q9D6F4 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gabra4Q9D6F4 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gabra4Q9D6F4 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gabra4Q9D6F4 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gabra4Q9D6F4 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gabra4Q9D6F4 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gabra4Q9D6F4 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gabra4Q9D6F4 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gabra4Q9D6F4 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gabra4Q9D6F4 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gabra4Q9D6F4 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gabra4Q9D6F4 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gabra4Q9D6F4 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gabra4Q9D6F4 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gabra4Q9D6F4 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gabra4Q9D6F4 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gabra4Q9D6F4 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gabra4Q9D6F4 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gabra4Q9D6F4 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gabra4Q9D6F4 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gabra4Q9D6F4 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gabra4Q9D6F4 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gabra4Q9D6F4 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gabra4Q9D6F4 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gabra4Q9D6F4 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gabra4Q9D6F4 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gabra4Q9D6F4 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gabra4Q9D6F4 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gabra4Q9D6F4 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gabra4Q9D6F4 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gabra4Q9D6F4 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabra4Q9D6F4 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabra4Q9D6F4 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabra4Q9D6F4 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabra4Q9D6F4 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabra4Q9D6F4 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabra4Q9D6F4 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabra4Q9D6F4 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabra4Q9D6F4 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabra4Q9D6F4 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabra4Q9D6F4 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabra4Q9D6F4 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabra4Q9D6F4 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabra4Q9D6F4 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabra4Q9D6F4 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabra4Q9D6F4 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabra4Q9D6F4 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabra4Q9D6F4 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabra4Q9D6F4 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabra4Q9D6F4 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabra4Q9D6F4 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabra4Q9D6F4 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabra4Q9D6F4 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabra4Q9D6F4 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabra4Q9D6F4 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabra4Q9D6F4 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabra4Q9D6F4 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabra4Q9D6F4 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabra4Q9D6F4 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabra4Q9D6F4 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabra4Q9D6F4 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabra4Q9D6F4 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabra4Q9D6F4 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabra4Q9D6F4 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabra4Q9D6F4 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabra4Q9D6F4 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabra4Q9D6F4 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabra4Q9D6F4 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabra4Q9D6F4 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabra4Q9D6F4 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabra4Q9D6F4 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabra4Q9D6F4 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabra4Q9D6F4 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabra4Q9D6F4 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gabra4Q9D6F4 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gabra4Q9D6F4 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gabra4Q9D6F4 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gabra4Q9D6F4 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gabra4Q9D6F4 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gabra4Q9D6F4 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gabra4Q9D6F4 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms