Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Rab11fip1Q9D620 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Rab11fip1Q9D620 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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