Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q8

Uncharacterized protein C1orf141 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D5Q8 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms