Protein–RNA interactions for Protein: Q9D593

Atp6v1e2, V-type proton ATPase subunit E 2, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v1e2Q9D593 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp6v1e2Q9D593 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp6v1e2Q9D593 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp6v1e2Q9D593 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp6v1e2Q9D593 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp6v1e2Q9D593 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp6v1e2Q9D593 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp6v1e2Q9D593 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp6v1e2Q9D593 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp6v1e2Q9D593 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp6v1e2Q9D593 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp6v1e2Q9D593 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp6v1e2Q9D593 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp6v1e2Q9D593 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp6v1e2Q9D593 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp6v1e2Q9D593 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6v1e2Q9D593 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6v1e2Q9D593 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6v1e2Q9D593 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6v1e2Q9D593 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6v1e2Q9D593 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6v1e2Q9D593 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6v1e2Q9D593 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6v1e2Q9D593 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6v1e2Q9D593 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6v1e2Q9D593 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6v1e2Q9D593 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6v1e2Q9D593 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6v1e2Q9D593 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6v1e2Q9D593 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6v1e2Q9D593 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6v1e2Q9D593 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6v1e2Q9D593 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6v1e2Q9D593 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6v1e2Q9D593 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6v1e2Q9D593 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6v1e2Q9D593 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6v1e2Q9D593 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6v1e2Q9D593 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6v1e2Q9D593 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6v1e2Q9D593 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6v1e2Q9D593 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6v1e2Q9D593 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6v1e2Q9D593 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6v1e2Q9D593 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6v1e2Q9D593 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6v1e2Q9D593 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6v1e2Q9D593 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6v1e2Q9D593 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6v1e2Q9D593 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6v1e2Q9D593 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6v1e2Q9D593 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6v1e2Q9D593 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6v1e2Q9D593 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6v1e2Q9D593 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6v1e2Q9D593 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6v1e2Q9D593 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6v1e2Q9D593 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6v1e2Q9D593 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6v1e2Q9D593 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6v1e2Q9D593 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6v1e2Q9D593 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6v1e2Q9D593 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6v1e2Q9D593 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6v1e2Q9D593 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6v1e2Q9D593 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6v1e2Q9D593 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6v1e2Q9D593 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6v1e2Q9D593 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6v1e2Q9D593 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6v1e2Q9D593 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6v1e2Q9D593 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp6v1e2Q9D593 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp6v1e2Q9D593 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp6v1e2Q9D593 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp6v1e2Q9D593 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp6v1e2Q9D593 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp6v1e2Q9D593 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp6v1e2Q9D593 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp6v1e2Q9D593 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp6v1e2Q9D593 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp6v1e2Q9D593 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp6v1e2Q9D593 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp6v1e2Q9D593 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp6v1e2Q9D593 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp6v1e2Q9D593 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp6v1e2Q9D593 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp6v1e2Q9D593 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp6v1e2Q9D593 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp6v1e2Q9D593 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp6v1e2Q9D593 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp6v1e2Q9D593 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp6v1e2Q9D593 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp6v1e2Q9D593 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp6v1e2Q9D593 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp6v1e2Q9D593 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp6v1e2Q9D593 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp6v1e2Q9D593 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atp6v1e2Q9D593 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atp6v1e2Q9D593 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms