Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms