Protein–RNA interactions for Protein: Q9D454

Uncharacterized protein CXorf49 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D454 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D454 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D454 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D454 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D454 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D454 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D454 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D454 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D454 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D454 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D454 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D454 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D454 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D454 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D454 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D454 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D454 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D454 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D454 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D454 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D454 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D454 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D454 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D454 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D454 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D454 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D454 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D454 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D454 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D454 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D454 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D454 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D454 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D454 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D454 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D454 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D454 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D454 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D454 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D454 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D454 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D454 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D454 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D454 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D454 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D454 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D454 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D454 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D454 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D454 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D454 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D454 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D454 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D454 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D454 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D454 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D454 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D454 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D454 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D454 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D454 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D454 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D454 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D454 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D454 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D454 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D454 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D454 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D454 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D454 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D454 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D454 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D454 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D454 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D454 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D454 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D454 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D454 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D454 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D454 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D454 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D454 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D454 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D454 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D454 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D454 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D454 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D454 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D454 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D454 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D454 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D454 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D454 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D454 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D454 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D454 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D454 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D454 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D454 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D454 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms