Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cfap53Q9D439 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cfap53Q9D439 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cfap53Q9D439 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cfap53Q9D439 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfap53Q9D439 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfap53Q9D439 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfap53Q9D439 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfap53Q9D439 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfap53Q9D439 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfap53Q9D439 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfap53Q9D439 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfap53Q9D439 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfap53Q9D439 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfap53Q9D439 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfap53Q9D439 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfap53Q9D439 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfap53Q9D439 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfap53Q9D439 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfap53Q9D439 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfap53Q9D439 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfap53Q9D439 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfap53Q9D439 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfap53Q9D439 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfap53Q9D439 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfap53Q9D439 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfap53Q9D439 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfap53Q9D439 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms