Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms