Protein–RNA interactions for Protein: Q9D061

Acbd6, Acyl-CoA-binding domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acbd6Q9D061 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acbd6Q9D061 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acbd6Q9D061 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acbd6Q9D061 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acbd6Q9D061 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acbd6Q9D061 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acbd6Q9D061 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acbd6Q9D061 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acbd6Q9D061 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acbd6Q9D061 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acbd6Q9D061 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acbd6Q9D061 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acbd6Q9D061 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acbd6Q9D061 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Acbd6Q9D061 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acbd6Q9D061 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acbd6Q9D061 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Acbd6Q9D061 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acbd6Q9D061 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acbd6Q9D061 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acbd6Q9D061 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acbd6Q9D061 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acbd6Q9D061 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acbd6Q9D061 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acbd6Q9D061 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Acbd6Q9D061 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acbd6Q9D061 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acbd6Q9D061 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acbd6Q9D061 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acbd6Q9D061 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acbd6Q9D061 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acbd6Q9D061 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acbd6Q9D061 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acbd6Q9D061 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acbd6Q9D061 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acbd6Q9D061 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acbd6Q9D061 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Acbd6Q9D061 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acbd6Q9D061 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acbd6Q9D061 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acbd6Q9D061 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Acbd6Q9D061 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Acbd6Q9D061 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acbd6Q9D061 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acbd6Q9D061 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acbd6Q9D061 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acbd6Q9D061 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acbd6Q9D061 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acbd6Q9D061 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acbd6Q9D061 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Acbd6Q9D061 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acbd6Q9D061 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acbd6Q9D061 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acbd6Q9D061 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acbd6Q9D061 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acbd6Q9D061 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acbd6Q9D061 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acbd6Q9D061 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Acbd6Q9D061 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acbd6Q9D061 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Acbd6Q9D061 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Acbd6Q9D061 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acbd6Q9D061 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acbd6Q9D061 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acbd6Q9D061 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acbd6Q9D061 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acbd6Q9D061 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Acbd6Q9D061 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acbd6Q9D061 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acbd6Q9D061 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acbd6Q9D061 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acbd6Q9D061 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acbd6Q9D061 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acbd6Q9D061 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acbd6Q9D061 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acbd6Q9D061 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Acbd6Q9D061 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acbd6Q9D061 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acbd6Q9D061 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acbd6Q9D061 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acbd6Q9D061 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acbd6Q9D061 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acbd6Q9D061 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acbd6Q9D061 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acbd6Q9D061 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acbd6Q9D061 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acbd6Q9D061 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acbd6Q9D061 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acbd6Q9D061 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acbd6Q9D061 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acbd6Q9D061 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acbd6Q9D061 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acbd6Q9D061 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acbd6Q9D061 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acbd6Q9D061 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acbd6Q9D061 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acbd6Q9D061 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acbd6Q9D061 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acbd6Q9D061 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acbd6Q9D061 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms