Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx7Q9CY18 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx7Q9CY18 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx7Q9CY18 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx7Q9CY18 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx7Q9CY18 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx7Q9CY18 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx7Q9CY18 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx7Q9CY18 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx7Q9CY18 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx7Q9CY18 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx7Q9CY18 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx7Q9CY18 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx7Q9CY18 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx7Q9CY18 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx7Q9CY18 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Snx7Q9CY18 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx7Q9CY18 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Snx7Q9CY18 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx7Q9CY18 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx7Q9CY18 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx7Q9CY18 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Snx7Q9CY18 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Snx7Q9CY18 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx7Q9CY18 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx7Q9CY18 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Snx7Q9CY18 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx7Q9CY18 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Snx7Q9CY18 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx7Q9CY18 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx7Q9CY18 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx7Q9CY18 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx7Q9CY18 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Snx7Q9CY18 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx7Q9CY18 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx7Q9CY18 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx7Q9CY18 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Snx7Q9CY18 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx7Q9CY18 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx7Q9CY18 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx7Q9CY18 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx7Q9CY18 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx7Q9CY18 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx7Q9CY18 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx7Q9CY18 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx7Q9CY18 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx7Q9CY18 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx7Q9CY18 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx7Q9CY18 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx7Q9CY18 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx7Q9CY18 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx7Q9CY18 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Snx7Q9CY18 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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