Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXT8

Pmpcb, Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmpcbQ9CXT8 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms