Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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