Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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