Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9CRC3 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9CRC3 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9CRC3 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9CRC3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q9CRC3 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q9CRC3 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q9CRC3 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Q9CRC3 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Q9CRC3 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Q9CRC3 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Q9CRC3 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Q9CRC3 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Q9CRC3 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Q9CRC3 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Q9CRC3 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Q9CRC3 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Q9CRC3 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Q9CRC3 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Q9CRC3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Q9CRC3 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Q9CRC3 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9CRC3 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9CRC3 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9CRC3 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9CRC3 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9CRC3 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9CRC3 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9CRC3 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9CRC3 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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