Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms