Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms