Protein–RNA interactions for Protein: Q99P81

Abcg3, ATP-binding cassette sub-family G member 3, mousemouse

Predictions only

Length 650 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg3Q99P81 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcg3Q99P81 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcg3Q99P81 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcg3Q99P81 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcg3Q99P81 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcg3Q99P81 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcg3Q99P81 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcg3Q99P81 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcg3Q99P81 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcg3Q99P81 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcg3Q99P81 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcg3Q99P81 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcg3Q99P81 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcg3Q99P81 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcg3Q99P81 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcg3Q99P81 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcg3Q99P81 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcg3Q99P81 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcg3Q99P81 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcg3Q99P81 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcg3Q99P81 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcg3Q99P81 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcg3Q99P81 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcg3Q99P81 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcg3Q99P81 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcg3Q99P81 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcg3Q99P81 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcg3Q99P81 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcg3Q99P81 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcg3Q99P81 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcg3Q99P81 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcg3Q99P81 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcg3Q99P81 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcg3Q99P81 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcg3Q99P81 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcg3Q99P81 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcg3Q99P81 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcg3Q99P81 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcg3Q99P81 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcg3Q99P81 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcg3Q99P81 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcg3Q99P81 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcg3Q99P81 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcg3Q99P81 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcg3Q99P81 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcg3Q99P81 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcg3Q99P81 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcg3Q99P81 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcg3Q99P81 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcg3Q99P81 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcg3Q99P81 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcg3Q99P81 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcg3Q99P81 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcg3Q99P81 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcg3Q99P81 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcg3Q99P81 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcg3Q99P81 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcg3Q99P81 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcg3Q99P81 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcg3Q99P81 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcg3Q99P81 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcg3Q99P81 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcg3Q99P81 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcg3Q99P81 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcg3Q99P81 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcg3Q99P81 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcg3Q99P81 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcg3Q99P81 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcg3Q99P81 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcg3Q99P81 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcg3Q99P81 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcg3Q99P81 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcg3Q99P81 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcg3Q99P81 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcg3Q99P81 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcg3Q99P81 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcg3Q99P81 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcg3Q99P81 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcg3Q99P81 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcg3Q99P81 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcg3Q99P81 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcg3Q99P81 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcg3Q99P81 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcg3Q99P81 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcg3Q99P81 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcg3Q99P81 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcg3Q99P81 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcg3Q99P81 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcg3Q99P81 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcg3Q99P81 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcg3Q99P81 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcg3Q99P81 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcg3Q99P81 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcg3Q99P81 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcg3Q99P81 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcg3Q99P81 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcg3Q99P81 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcg3Q99P81 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcg3Q99P81 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcg3Q99P81 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms